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41 | 42 | 43 | 44 | 45 | 46 | 47 | 48 |
Figure: Differential Scanning Fluorimetry Curve.
Fluorescence Intensity (arbitrary units) vs Temperature (°C).
Observed intensity, black '+'; smoothed observations, black curve;
final fitted model, red curve; residual (smoothed observations - fit),
green curve; background, blue curve.
Transition midpoint temperature (Tm) and
transition intensity range from Imin to Imax,
vertical thick blue bar(s); transition temperature range
(full width at half maximum slope, FWHM) and
intensity at transition midpoint (ITm),
horizontal thick green bar(s).
Curve Fitting: Unsmoothed observed fluorescence intensity is fit with a background
and one or more intensity transitions In:
I = Ibg + I1 + I2 + …
where
In = ΔI /
{1 + e(TM - T) / TW } ,
ΔI = Imax - Imin and
TW is proportional to the full width at half maximal slope
(FWHM). Ibg = Imin for the first transition
(constant) unless exponentially decaying
background is allowed with the -x option and decay is detected, in which
case either:
Ibg = Iinit × ekT
(decay from Iinit to zero)
or Ibg = Imin +
(Iinit - Imin) × ekT
(decay from Iinit to Imin).
When Imin is far below zero, this gives a nearly
linear decreasing background.
Table: Transition Models.
Overall data problems, if any, in text above table. If no transition
found, no table is displayed.
Problems with fitting, if any, to the right.
Pale green background, transition(s) with maximum slope or ΔI.
Since these may be in different rows, transition are numbered from low to high
Tm rather than by slope or ΔI.
Tm, transition midpoint;
s.d., deviation of observed from expected intensity near Tm.
Note: this s.d. indicates data and fit quality of one experiment, not expected deviation
between experiments.
Slope, (dI/dT)max = dI/dT at Tm from model.
Delta, transition intensity change ΔI relative to
maximum observed intensity:
ΔI / Imax obs
(and relative to the largest ΔI:
ΔI / ΔImax).
For data baselined to minimum intensity, a common default setting,
Imax obs is the total observed intensity change.
If that change is largely due to intensity decay, then
Σ (ΔIi / Imax obs) << 1.
FWHM, temperature range with slope ≥ half maximal slope.
See details for values from
models with other numbers of transitions.
Sample 1: A1 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: intensity plateaus at 52.7 C
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Sample 2: A2 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 3: A3 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: intensity plateaus at 62.5 C
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Sample 4: A4 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: sudden intensity jump at 55.1 C
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Sample 5: A5 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: sudden intensity jump at 53.9 C
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Sample 6: A6 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: intensity plateaus at 62.1 C
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Sample 7: A7 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: intensity plateaus at 53.7 C
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Sample 8: A8 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 9: A9 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 10: A10 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 11: A11 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: intensity plateaus at 61.3 C
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Sample 12: A12 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 13: B1 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 14: B2 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: sudden intensity jump at 53.7 C
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Sample 15: B3 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: sudden intensity jump at 53.7 C
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Sample 16: B4 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 17: B5 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
![]() | Data problem: sudden intensity jump at 58.9 C
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Sample 18: B6 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 19: B7 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 20: B8 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 21: B9 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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No transition found No positive slope |
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Sample 22: B10 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 23: B11 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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No transition found No positive slope |
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Sample 24: B12 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 25: C1 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 26: C2 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 27: C3 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 28: C4 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 29: C5 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 30: C6 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 31: C7 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 32: C8 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 33: C9 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 34: C10 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 35: C11 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 36: C12 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 37: D1 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 38: D2 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 39: D3 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 40: D4 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 41: D5 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 42: D6 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 43: D7 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 44: D8 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 45: D9 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 46: D10 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 47: D11 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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Sample 48: D12 (details) | ||||||||||||||||||||||||||
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